Con el fin de responder a la necesidad de formación de investigación y profesionales docentes, el Departamento cuenta dos programas de Magíster y un Doctorado. Todos articulados con Ingeniería Civil Informática para facilitar el acceso a postgrado.
-En el año 1992 inicia su funcionamiento el programa de Magíster en Ciencias de la Ingeniería Informática (MII).
-En el año 2003 comienza el Doctorado en Ingeniería Informática (DII).
-En el año 2004 se crea el Magíster en Tecnología de la Información (MTI).
